2012年10月下旬，南矶保护区全面开展2012-2013越冬候鸟同步监测工作的实施工作，本项工作旨在配合鄱阳湖科学考察项目，全面定期了解和掌握保护区越冬鸟类种群及其越冬栖息地的现状，评价越冬栖息地变化对其越冬种群的影响，为鄱阳湖乃至整个长江中下游越冬候鸟栖息生境的有效管理提供政策参考和理论依据，

本次检测工作，共分前期准备、具体实施、总结成果三个阶段进行，具体实施的时间由2012年10月至2013年3月，历时六个月。此次调查共分四个组，二个方向即恒湖方向、南矶山方向，四条检测样带，由局领导亲自带队采取徒步同步的调查方法，监测越冬的野生动物，尤其是候鸟；并针对南矶湿地保护区内包涵的种群数量、物种分布、栖息地类型、人为干扰因素等四项关键指标做全面调查、分析。